Основною сферою застосування водню є виробництво хімічних продуктів виробництва аміаку NH₃, метанолу СН₃ОН та інших спиртів, альдегідів, кетонів для гідрогенізації твердого та важкого рідкого палива, жирів та різних органічних сполук, для синтезу хлороводню НС1, гідроочищення продуктів переробки нафти.

Металургія

• для горіння водню в кисні, обумовлює використання водневого пальника для зварювання та різання металів (температура водневого полум’я досягає 2600 °С)
• термічна обробка холоднокатаного прокату
• атомарно-водневе зварювання (4000 °С), електричне зварювання дугою змінного струму, що горить між двома вольфрамовими електродами в атмосфері водню
• за допомогою водню відновлюють деякі кольорові метали з їхніх оксидів (отримання молібдену, вольфраму та інших металів)
• термоводнева обробка титанових сплавів
• для створення захисної азотно-водневої атмосфери при термообробці труб

Метеорологія

• для заповнення оболонок метеозондів

Склодувна промисловість

• водень використовується при виробництві листового скла флоат-методом та при отриманні кварцового скла, що виготовляється плавленням кварцу, гірського кришталю або синтетичного діоксиду кремнію в киснево-водневому полум’ї

Харчова та косметична промисловість

• водень застосовується при виробництві маргарину методом гідрогенізації рідких рослинних жирів у твердий жир

Лабораторне застосування

• у хімічних лабораторіях як газ-носій у газовій хроматографії
• випробування на герметичність

• Роботу з воднем дозволяється проводити тільки в обладнаних для цієї мети приміщеннях, в яких є надійна вентиляція з витяжкою з верхньої зони, а електроустаткування змонтоване у вибухобезпечному виконанні.
• Приміщення для зберігання балонів із воднем обладнується природною вентиляцією з витяжкою: із верхньої зони.
• Зберігання балонів з воднем сумісно з  киснем, хлором, закисом азоту та інші окислювачами, як і з легкозаймистими речовинами, забороняється.
• Відбір газу з балона повинен проводитися тільки через редуктор, призначений для водню.
• При виконанні досліджень з використанням чистого водню, а також водневих сумішей (особливо у разі проведення робіт на дослідних установках із застосуванням великих обсягів газу) скидання промивних та відпрацьованих газових сумішей слід проводити по спеціальних трубках в атмосферу за вікно.
• Відведення має проводитися у відкриту атмосферу міцним трубопроводом і досить повільно, щоб усунути можливість вибуху суміші на виході. Рекомендується суміш розбавляти в трубопроводі інертним газом. Відкачувати відвідними трубками відпрацьований водень або водневі суміші форвакуумним насосом забороняється.
• Під час використання балона, необхідно обов’язково залишати у ньому водень з надлишковим тиском щонайменше 0,5 кгс/см2.
• Після завершення експлуатації балона, вентиль на балоні потрібно щільно закрити і стравити газ з редуктора. Залишати редуктор під тиском забороняється.